Apresentaremos agora os antagonistas e seus planos diabólicos:
Dominando Kanto e Johto
Equipe Rocket é um sindicato criminal altamente organizado "em busca do mal" encabeçado por Giovanni {Sakaki}{suposto pai de Ash}{chamado "O Chefe", por seus subordinados} e baseado em Kanto. Seu principal foco está em roubar, em seguida, vender, Pokémon raros e fortes, mas ela também realiza uma cruel pesquisa experimental sobre Pokémon. De acordo com os jogos da Geração II, o Juramento da Equipe Rocket diz: "Roubar Pokémon para o lucro. Vender Pokémon para o lucro. Todo Pokémon existe para a glória da Equipe Rocket". A meta final da Equipe Rocket é dominar o mundo utilizando Pokémon. Há um trio da Equipe Rocket que foi designado de pegar o Pikachu de Ash, mas sempre falha, seguindo o treinador em sua jornada e tentando roubar os Pokémon que vêem. São Jesse {Musashi}, James {Koujiro} e um Meowth {tipo Normal} falante que vive fazendo fantasias sobre como agradar O Chefe. Eles vivem repetindo o hino e atrapalhando Ash e seus amigos na jornada.
Em Hoenn... 
Equipe Aqua é uma das duas equipes criminosas encontradas em Hoenn. Eles pretendem elevar o nível dos oceanos usando o poder do Pokémon lendário Kyogre {Água}. O líder da Equipe Aqua é Archie {Aogiri} e seu rival é a Equipe Magma. O uniforme é uma camisa branca e cinza, calça jeans com círculos brancos, luvas pretas e um lenço azul com o símbolo da equipe.
Equipe Magma é a 
outra equipe vilã de Hoenn. A meta da Equipe Magma é expandir os continentes com o poder de Groudon {Terra}. O líder da Equipe Magma é Maxie {Matsubusa}. Os seus uniformes são uma camiseta preta, calças curtas pretas para os homens e as mulheres de saia preta, com um casaco vermelho curto.
A Equipe Galática é a vilã de Sinnoh. Sua meta é controlar Dialga {Metálico/Dragão} e Palkia {Água/Dragão}. A equipe é comandada por Cyrus {Akagi} e seus administradores são Saturno {Saturn}, Marte {Mars} e Júpiter {Jupiter}.Eles atacam várias vezes no anime, porém tendo seus planos frustrados por Ash e seus amigos nas três primeiras vezes. Não só no uniforme, mas todos os soldados da equipe são bem parecidos e receberam o apelido de "Estilo Adorável". 
Na região de Orre, a equipe do mal é a Snagem. Sua base é localizada no Eclo Canyon. A equipe rouba Pokémon de outros treinadores.
Em Fiore
O Esquadrão Go-Rock {Go-Rock Squad} detona em Fiore. Seu líder é Gordor. Ele criou o Esquadrão Go-Rock quando sentiu que ficou em segundo lugar atrás de Hastings quando foram colegas na escola. Seu plano é destruir todos os Rangers e substituí-los com o Esquadrão Go-Rock para roubar o Poder Styler e usá-lo para capturar Raikou, Suicune e Entei. Depois de sua 
derrota pelos Rangers, Gordor foge, mas retorna depois para recuperar o ovo de Manaphy, pára a última tentativa de atacar com o Go-Rock, e retorna os Rangers para Professor Hastings. Depois de sua derrota no Templo Fiore, ele parece ter abandonado os seus planos infames. Gordor é o pai dos Go-Rock Quads, os administradores do esquadrão.
E em Almia... 
A Equipe Dim Sun é a organização vilã de Almia. Liderado por um homem cercado de mistério, seu objetivo é despertar Darkrai {Noturno} e sugar o mundo em uma dimensão paralela. Para convocar Darkrai, eles recolhem três pedras que são em forma de uma labareda, uma gota de água, e uma lua. Quando as pedras estão unidas perto de uma pedra gigante roxa, conhecida como o Cristal Sombrio, Darkrai desperta. Eles se sucedem bem no despertar de Darkrai, mas ainda há algo. A Torre Altru é secretamente usada para completar os tais planos. O presidente da Altru, Blake Hall 
dirige bem Altru após herdá-la de seu pai, porém ele secretamente é o líder da Equipe Dim Sun. Eles usaram o cientista Isaac para desenvolver as Unidades Gigaremo com ele acreditando que estava ajudando os Pokémon em Almia. Enquanto a identidade do chefe é ocultada, sua subchefe Kincaid mantém um alto perfil, primeiro como professor na Escola Ranger, onde ele secretamente recruta estudantes para a equipe, e mais tarde como um comandante direto para classificação de membros menores. Três outros membros conhecido como o Trio Sinis respondem diretamente à Kincaid. Eles hipnotizam Pokémon com máquinas estranhas chamadas Unidades Gigaremo. Eles usam depois máquinas chamadas de Miniremos. Eles construiram uma Unidade Gigaremo maior conhecida como a Máquina Incrível, que mais tarde se descobriu ser a Torre Altru. É a tarefa dos Rangers destruir estas unidades e livrar os Pokémon da hipnose.
